Diketahui Pondok Pesantren Al Zaytun Indramayu, Jawa Barat, menjadi pusat kontroversi karena dianggap menyebarkan ajaran-ajaran diduga menyimpang. Hal ini membuat masyarakat merasa cemas, sehingga tak sedikit yang meminta pihak berwenang untuk mengambil tindakan tegas dalam menangani masalah ini. Senada dengan UAS, Habib Rizieq Shihab juga “Keponakan saya, anak kakak saya tertua, anak-anaknya sekolahnya di Al Zaytun (nggak ada yang sesat).Sejak kapan ada pondok pesantren mengajarkan orang berzina boleh nanti bayar, sejak kapan ada pondok pesantren mengajarkan orang melakukan kaderisasi membangun negara di negara yang lain dalam pondok pesantren,” ujar Ngabalin dikutip VIVA, Jumat 7 Juli 2023 Liputan6.com, Jakarta - Lama tak terdengar kabarnya, Ponpes Al Zaytun di Kabupaten Indramayu, Jawa Barat kembali jadi bahan pembicaraan usai beredarnya rekaman video sholat Idul Fitri di yang mencampur jamaah laki-laki dan perempuan dalam shaf yang sama. Sebelumnya, Presiden Joko Widodo atau Jokowi membantah isu bahwa ada pihak Istana yang membekingi pondok pesantren (ponpes) Al Zaytun, Indramayu. Dia juga membantah Kepala Staf Kepresidenan Moeldoko sebagai salah satu sosok yang membekingi Ponpes Al Zaytun. Dari sukses pengumpulan dana inilah, ujar Ken, Panji Gumilang membangun komplek pondok pesantren Al-Zaytun di Indramayu, Jawa Barat, yang cukup besar dan relatif berfasilitas bagus. Sumber kekayaan Pesantren Al Zaytun dilansir dari berbagai yakni dari uang masuk pendaftaran. Biaya Ponpes Al Zaytun Indramayu di atas terdiri atas pendidikan, perlengkapan tidur, perlengkapan makan, listrik 1 tahun, perawatan asrama 1 tahun, kursi dan jemuran 3 tahun, seragam MI, pembuatan BIT, ekstrakulikuler olahraga dan seni 1 tahun, kegiatan organsisasi santri 1 tahun, administrasi Namun, saat disinggung apakah MUI akan dilibatkan dalam proses pembinaan Al Zaytun, mantan wakil menteri agama tersebut menyerahkannya kepada Kementerian Agama. "Tanyakan ke Pak Menteri Agama ya, saya tidak punya kewenangan," ujar dia. Menteri Koordinator Bidang Politik, Hukum, dan Keamanan Mahfud MD menegaskan, pemerintah memastikan kegiatan Kantor Iklan. Menara Kompas Lantai 2, Jalan Palmerah Selatan 21, Jakarta Pusat, DKI Jakarta, Indonesia, 10270. Tlp. +6221 8062 6699. Presiden Jokowi membantah pihak Istana melindungi keberadaan Pondok Pesantren Al-Zaytun di Indramayu. Ia juga menepis tudingan Kepala Staf Kepresidenan Moeldoko melindungi pondok pesantren tersebut. Tim Peneliti Ma’had Al-Zaytun MUI. 2002. Laporan Lengkap Hasil Penelitian Ma’had Al-Zaytun Haurgeulis Indramayu. Jakarta: MUI. Tolkhah, Imam dan Choirul Fuad. 2002. Ma’had Al-Zaytun di Indramayu. Jakarta: Badan Litbang Agama dan Diklat Keagamaan. Wahid, Abdurahman. 2007. Menggerakkan Tradisi: Esai-esai Pesantren. Yogyakarta: LKIS. Yasmadi Sumbawanews.com mengutip dari Republika.co.id dari berbagai sumber, berikut ini deretan pejabat dan tokoh yang pernah berkunjung ke Pesantren Al Zaytun: 1. AM Hendropriyono. Mantan Kepala Badan Intelijen Negara (BIN), A.M. Hendropriyono yang ternyata pernah berkunjung ke Al-Zaytun. Ia tercatat berkunjung ke Ma`had Al-Zaytun, Indramayu t8bN.